Na versão 28.7 já é possível fazer o desbloqueio SEFAZ manual, conforme o passo a passo abaixo:

1) Acesse a rotina 530 - Permitir Acesso a Rotina

2) Marque a opção 29 - Permite realizar o desbloqueio / bloqueio manual do cliente na SEFAZ 

3) Clique Confirmar;

4) Acesse a rotina 1203 - Extrato de Cliente e preencha os campos conforme necessidade;

5) Marque a opção Bloqueio Sefaz;

6) Clique Confirmar;

Mas se for utilizado uma versão diferente da 28.7, o sistema não permite desbloquear um cliente na rotina 1203 quando o bloqueio é feito pela SEFAZ. Mas se na rotina 132 - Parâmetros da presidência, o parâmetro 2385 - Permitir digitar pedido de cliente com bloqueio SEFAZ, estiver marcado, ele irá permitir que seja digitado um pedido de venda de cliente com restrição na SEFAZ.
Assim, caso seja necessário emitir um pedido sem que tenha sido gerado o arquivo na rotina 1075 - Validação de Dados Fiscais - SEFAZ, para conseguir emitir o pedido pode ser marcado esse parâmetro.