É necessário infomar:

A opção Todas as empresas indica que o usuário tem acesso a todas as filiais existentes e, também, às que devem ser criadas, entretanto, se ela estiver desmarcada e o usuário possuir acesso a todas as empresas e filiais, o Sistema não realiza a permissão no momento da inclusão de empresas e/ou filiais.

Ao cadastrar um usuário, os campos estão em branco, o que demonstra que ele não tem acesso a nenhuma filial, assim, para que essa situação possa ser alterada, é necessário informar:

Importante:

Caso seja necessário restringir o acesso a uma Filial ou a uma Unidade de Negócio ou a uma Empresa, basta por exemplo informar os dados daquele que deve ser restringido e deixar a opção desmarcada.